Shpagin đã được trao tặng Giải thưởng Stalin hạng 2 năm 1941 và danh hiệu Anh hùng Lao động Xã hội Chủ nghĩa vào ngày 16 tháng 9 năm 1945, vì "chế tạo ra các loại vũ khí mới và nâng cao sức mạnh chiến đấu của Hồng quân". Ông đã nhận được ba Huân chương Lenin trong chiến tranh, vào các năm 1941, 1943 và 1945, cùng với Huân chương Suvorov hạng 2 năm 1945 và Huân chương Sao Đỏ năm 1938.